Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lig1P37913 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms