Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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