Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SsbP32067 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SsbP32067 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SsbP32067 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SsbP32067 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms