Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OatP29758 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OatP29758 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OatP29758 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OatP29758 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms