Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms