Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3aP23116 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms