Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms