Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TP20293 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TP20293 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TP20293 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TP20293 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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