Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sptan1P16546 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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