Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RhoP15409 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RhoP15409 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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