Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmnb1P14733 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmnb1P14733 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms