Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms