Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms