Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calm3P0DP28 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calm3P0DP28 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms