Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd3P09027 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms