Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms