Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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