Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01678 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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P01678 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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P01678 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01678 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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P01678 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01678 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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