Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stra6O70491 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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