Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt1O35449 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms