Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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