Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3278L7N2D2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3278L7N2D2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3278L7N2D2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3278L7N2D2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm3278L7N2D2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3278L7N2D2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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