Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm8356J3QPD3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm8356J3QPD3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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