Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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