Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc180J3QNE4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms