Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20825J3QM67 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms