Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20671F6TVX7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20671F6TVX7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms