Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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