Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm340F6RGI3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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