Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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