Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clrn2B2RVW2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clrn2B2RVW2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms