Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc8B2RUS7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc8B2RUS7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms