Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud7bB2RUR8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud7bB2RUR8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms