Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprsB0V2N1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprsB0V2N1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms