Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syndig1A2ANU3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms