Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn7Q9Z261 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms