Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChmlQ9QZD5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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ChmlQ9QZD5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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