Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt3Q9QZ47 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms