Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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