Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms