Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms