Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rhox9Q9EQM5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhox9Q9EQM5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms