Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ftsj3Q9DBE9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms