Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp4bQ9D8B3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms