Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Cldn23Q9D7D7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Cldn23Q9D7D7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Cldn23Q9D7D7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Cldn23Q9D7D7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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