Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms