Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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