Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fndc8Q9D2H8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms