Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed5Q9CXE7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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