Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Cnot11Q9CWN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cnot11Q9CWN7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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